Schwingungskreisendichroismus

Schwingungskreisendichroismus (VCD) ist ein spektroskopisch Technik, die Unterschiede bei der Abschwächung von links und rechts erkennt zirkular polarisiertes Licht durch eine Probe gehen. Es ist die Erweiterung von Kreisendichroismus Spektroskopie in die Infrarot und in der Nähe von Infrarot -Bereichen.[1]

Da VCD für die gegenseitige Ausrichtung verschiedener Gruppen in einem Molekül empfindlich ist, liefert es dreidimensionale Strukturinformationen. Somit ist es eine leistungsstarke Technik, da VCD -Spektren von Enantiomeren mit Verwendung simuliert werden können ab Initio Berechnungen, wodurch die Identifizierung absoluter Konfigurationen kleiner Moleküle in Lösung aus VCD -Spektren ermöglicht wird. Unter solchen Quantenberechnungen von VCD -Spektren infolge der chiralen Eigenschaften kleiner organischer Moleküle basieren diejenigen Dichtefunktionelle Theorie (DFT) und Messgeräte atomare Orbitale (Giao). Als einfaches Beispiel für die experimentellen Ergebnisse, die durch VCD erhalten wurden Aminosäuren in schweres Wasser Lösungen. Messungen der optischen Vibrationsaktivität (VOA) haben somit zahlreiche Anwendungen, nicht nur für kleine Moleküle, sondern auch für große und komplexe Biopolymere wie Muskelproteine ​​(Myosinzum Beispiel) und DNA.

Schwingungsmodi

Theorie

Während die mit der Infrarotabsorption verbundene grundlegende Menge die Dipolstärke ist, ist die differentielle Absorption auch proportional zur Rotationsstärke, eine Menge, die sowohl von den momenten elektrischen als auch von magnetischen Dipolübergang abhängt. Die Empfindlichkeit der Händigkeit eines Moleküls gegenüber zirkular polarisiertem Licht ergibt sich aus der Form der Rotationsfestigkeit. Eine strenge theoretische Entwicklung von VCD wurde gleichzeitig von dem verstorbenen Professor P.J. Stephens, FRS, am entwickelt Universität von Südkalifornien,[2][3] und die Gruppe von Professor A.D. Buckingham, FRS, bei Universität von Cambridge im Vereinigten Königreich,[4] und erstmals analytisch im Cambridge Analytical Derivativpaket (CADPAC) von R.D. Amos implementiert.[5] Frühere Entwicklungen von D.P. Craig und T. Thirmachandiman am Australian National University[6] und Larry A. Nafie und Teresa B. Freedman bei Syracuse University[7] Obwohl theoretisch korrekt, konnten sie nicht einfach implementiert werden, was ihre Verwendung verhinderte. Nur mit der Entwicklung des in CADPAC implementierten Stephens -Formalismus wurde eine schnell effiziente und theoretisch strenge theoretische Berechnung der VCD -Spektren von chiralen Molekülen machbar. Dies stimulierte auch die Kommerzialisierung von VCD-Instrumenten durch Biotools, Bruker, Jasco und Thermo-Nicolet (jetzt Thermo-Fisher).

Peptide und Proteine

Umfangreiche VCD -Studien wurden sowohl für Polypeptide als auch für mehrere Proteine ​​in Lösung berichtet.[8][9][10] Es wurden auch mehrere aktuelle Bewertungen zusammengestellt.[11][12][13][14] Eine umfangreiche, aber nicht umfassende Liste der VCD -Veröffentlichungen ist auch im Abschnitt "Referenzen" enthalten. Die veröffentlichten Berichte in den letzten 22 Jahren haben VCD als leistungsstarke Technik mit verbesserten Ergebnissen über die zuvor durch sichtbaren/UV -Kreis geschmückten Dichroismus (CD) oder vorgelegten optische rotatorische Dispersion (Ord) für Proteine ​​und Nukleinsäuren.

Die Auswirkungen von Lösungsmitteln auf die Stabilisierung der Strukturen (Konformere und Zwitterionspezies) von Aminosäuren und Peptiden sowie die entsprechenden Effekte, die im Schwingungskreisendichroismus (VCD) und Raman optische Aktivitätsspektren (ROA) beobachtet wurden Experimentelle Arbeiten zu L-Alanin und N-Acetyl L-Alanin N'-Methylamid.[15][16] Ähnliche Effekte wurden auch in den Spektren der Kernmagnetresonanz (NMR) von den Weise- und Weisshaar -NMR -Gruppen an der Universität von Wisconsin-Madison.[17]

Nukleinsäuren

VCD-Spektren von Nukleotiden, synthetischen Polynukleotiden und mehreren Nukleinsäuren, einschließlich DNA, wurden gemeldet und in Bezug auf die Art und Anzahl der Helices zugeordnet, die in A-, B- und Z-DNA vorhanden sind.

Instrumentierung

VCD kann als relativ jüngste Technik angesehen werden. Obwohl die optische Schwingungsaktivität und insbesondere die Schwingungskreisendichroismus, seit langem bekannt ist, wurde 1973 das erste VCD -Instrument entwickelt[18] und kommerzielle Instrumente waren erst seit 1997 verfügbar.[19]

Bei Biopolymeren wie Proteinen und Nukleinsäuren beträgt der Unterschied in der Absorption zwischen den Levo- und Dextro- und Dextro-Konfigurationen fünf Größenordnungen kleiner als die entsprechende (unpolarisierte) Absorption. Daher erfordert VCD von Biopolymeren die Verwendung von sehr empfindlichen, speziell gebauten Instrumenten sowie zeitliche Bestimmung über relativ lange Zeitintervalle, selbst mit solchen empfindlichen VCD-Spektrometern. Die meisten CD-Instrumente erzeugen links und rechts polarisiertes Licht, das dann entweder Sinuswellen- oder Quadratwellenmodulierung mit nachfolgender phasensensitiver Nachweis und Lock-In-Amplifikation des nachgewiesenen Signals wird. Im Fall von FT-VCD wird ein photoelastischer Modulator (PEM) in Verbindung mit einem FTIR-Interferometer-Setup verwendet. Ein Beispiel ist das eines Bomem-Modells MB-100-FTIR-Interferometer, das mit zusätzlichen polarisierenden Optik/ Zubehör ausgestattet ist, die für die Aufzeichnung von VCD-Spektren benötigt werden. Ein paralleler Strahl entsteht durch einen Seitenback des Interferometers, der zuerst durch einen linearen Kabelgitter und dann durch einen achteckig geformten Znse-Kristallpem führt, der den polarisierten Strahl bei einer festen, niedrigeren Frequenz wie 37,5 kHz moduliert. Ein mechanisch gestresster Kristall wie Znse -Exponate Birrbrecher Bei gestresstem benachbarten piezoelektrischen Wandler. Der lineare Polarisator ist in der Nähe und bei 45 Grad in Bezug auf die Znse -Kristallachse positioniert. Die auf den Detektor fokussierte polarisierte Strahlung wird sowohl vom PEM als auch durch das Interferometeraufbau doppelt moduliert. Ein sehr niedriger Rauschdetektor wie MCT (HGCDTE) wird auch für die phasensensitive VCD-Signal-Erkennung ausgewählt. Das erste dedizierte VCD-Spektrometer, das 1997 auf dem Markt gebracht wurde, war das Chiralir von Bomem/Biotools, Inc.[20] Um die Detektorsättigung zu verhindern, wird ein geeigneter Langwellenpassfilter vor dem sehr niedrigen MCT -Detektor platziert, wodurch nur Strahlung unter 1750 cm ermöglicht wird–1 den MCT -Detektor erreichen; Letzteres misst jedoch die Strahlung nur auf 750 cm–1. Anschließend wird die FT-VCD-Spektren der ausgewählten Probenlösung von einem Inline-Computer ausgeführt, digitalisiert und gespeichert. Veröffentlichte Bewertungen, die verschiedene VCD -Methoden vergleichen, sind ebenfalls verfügbar.[21][22]

Magnetischer VCD

VCD -Spektren wurden auch in Gegenwart eines angelegten externen Magnetfelds berichtet.[23] Diese Methode kann die VCD -Spektralauflösung für kleine Moleküle verbessern.[24][25][26][27][28]

Raman optische Aktivität (ROA)

Roa Ist eine Technik, die zu VCD ergänzt wird, die besonders nützlich in den 50–1600 cm ist–1 Spektralregion; Es wird als Technik der Wahl zur Bestimmung der optischen Aktivität für Photonenergien von weniger als 600 cm angesehen–1.

Siehe auch

Verweise

  1. ^ Prinzipien der IR- und NIR -Spektroskopie
  2. ^ Stephens Philip J (1985). "Theorie des Schwingungskreisendichroismus". Das Journal of Physical Chemistry. 89 (5): 748–752. doi:10.1021/j100251a006.
  3. ^ Stephens P. J. (1987). "Abhängigkeit von Schwingung magnetischen Dipolübergangsmomenten und Rotationsstärken". Das Journal of Physical Chemistry. 91 (7): 1712–1715. doi:10.1021/j100291a009.
  4. ^ Buckingham A.D., Fowler P.W., Galwas P.A. (1987). "Geschwindigkeitsabhängige Eigenschaftenoberflächen und die Theorie des Schwingungskreisendichroismus". Chemische Physik. 112 (1): 1–14. Bibcode:1987CP .... 112 .... 1B. doi:10.1016/0301-0104 (87) 85017-6.{{}}: Cs1 montiert: Mehrfachnamen: Autorenliste (Link)
  5. ^ Amos R. D., Handy N. C., Jalkanen K. J., Stephens P. J. (1987). "Effiziente Berechnung von Schwingungsmomenten mit magnetischem Dipolübergang und Rotationsstärken". Chemische Physikbuchstaben. 133 (1): 21–26. Bibcode:1987CPL ... 133 ... 21A. doi:10.1016/0009-2614 (87) 80046-5.{{}}: Cs1 montiert: Mehrfachnamen: Autorenliste (Link)
  6. ^ Craig D.P., Thirunamachandran T. (1978). "Eine Theorie des Schwingungskreisendichroismus in Bezug auf vibronische Wechselwirkungen". Molekulare Physik. 35 (3): 825–840. Bibcode:1978molph..35..825c. doi:10.1080/00268977800100611.
  7. ^ Nafie Laurence A., Freedman Teresa B. (1983). "Vibronische Kopplungstheorie von Infrarot -Schwingungsübergängen". Das Journal of Chemical Physics. 78 (12): 7108–7116. Bibcode:1983Jchph..78.7108n. doi:10.1063/1.444741.
  8. ^ P. Malon; R. Kobrinskaya; T. A. Keiderling (1988). "Schwingungskreisendichroismus von Polypeptiden xii. Neubewertung des Vierier-Transformation-Schwingungskreisendichroismus von Poly-Gamma-Benzyl-L-Glutamat". Biopolymere. 27 (5): 733–746. doi:10.1002/bip.360270503. PMID 2454680. S2CID 44963475.
  9. ^ T. A. Keiderling; S. C. Yasui; U. Narayanan; A. Annamalai; P. Malon; R. Kobrinskaya; et al. (1988). "Schwingungskreisendichroismus von Biopolymeren". In E. D. Schmid; F. W. Schneider; F. Siebert (Hrsg.). Spektroskopie biologischer Moleküle neue Fortschritte. Wiley. S. 73–76. ISBN 978-0-471-91934-6.
  10. ^ S. C. Yasui; T. A. Keiderling (1988). "Schwingungskreisendichroismus von Polypeptiden und Proteinen". Microchimica Acta. II (1–6): 325–327. Bibcode:1988Acmik ... 2..325y. doi:10.1007/bf01349780. S2CID 97091565.
  11. ^ T. A. Keiderling (1993). "Kapitel 8. Schwingungskreisendichroismus von Proteinen Polysaccharide und Nukleinsäuren". In I.C. Baianu; H. Pessen; T. Kumosinski (Hrsg.). Physikalische Chemie der Küchenprozesse. Vol. 2 Erweiterte Techniken, Strukturen und Anwendungen. New York: Van Norstrand-Reinhold. S. 307–337.
  12. ^ T. A. Keiderling & Qi Xu (2002). "Spektroskopische Charakterisierung von entfalteten Peptiden und Proteinen, die mit Infrarotabsorption und Schwingungskreisendichroismus -Spektren untersucht wurden". In George Rose (Hrsg.). Fortschritte in der Proteinchemie. Vol. 62. New York: Akademische Presse. S. 111–161.
  13. ^ Keiderling, Timothy A (2002). "Protein- und Peptid -Sekundärstruktur und Konformationsbestimmung mit Schwingungskreisendichroismus". Aktuelle Meinung in der chemischen Biologie. 6 (5): 682–8. doi:10.1016/s1367-5931 (02) 00369-1. PMID 12413554.
  14. ^ Timothy A. Keiderling & R. A. G. D. Silva (2002). "Überblick: Konformationsstudien von Peptiden mit Infrarottechniken". In M. Goodman; G. Herrman & Houben-Weyl (Hrsg.). Synthese von Peptiden und Peptidomimetika. Vol. 22eb. New York: Georg Thiem Verlag. S. 715–738 (geschrieben im Jahr 2000.
  15. ^ Jalkanen K. J., Degtyarenko I. M., Nieminen R. M., Cao X., Nafie L. A., Zhu F., Barron L. D. (2007). "Rolle der Hydratation bei der Bestimmung der Struktur und Schwingungsspektren von L-Alanin und N-Acetyl-L-Alanin-N'-methylamid in wässriger Lösung: ein kombinierter theoretischer und experimenteller Ansatz". Theoretische Chemiekonten. 119 (1–3): 191–210. doi:10.1007/s00214-007-0361-Z. S2CID 53533989.{{}}: Cs1 montiert: Mehrfachnamen: Autorenliste (Link)
  16. ^ Han Wen-Ge, Jalkanen K. J., Elstner Marcus, Suhai Sándor (1998). "Theoretische Untersuchung der wässrigen Acetyl-L-Alaninen-Methylamid: Strukturen und Raman-, VCD- und ROA-Spektren". Das Journal of Physical Chemistry B. 102 (14): 2587–2602. doi:10.1021/jp972299m.{{}}: Cs1 montiert: Mehrfachnamen: Autorenliste (Link)
  17. ^ Poon Chi-Duen, Samulski Edward T., Weise Christoph F., Weisshaar James C. (2000). "Brücken Wassermoleküle die Struktur eines Modelldipeptids in wässriger Lösung?" Zeitschrift der American Chemical Society. 122 (23): 5642–5643. doi:10.1021/ja993953+.{{}}: Cs1 montiert: Mehrfachnamen: Autorenliste (Link)
  18. ^ L. A. Nafie, T.A. Keiderling, P.J. Stephens, Jacs 1973, 98, 2715
  19. ^ Biotools -Katalog, Seite 4 Archiviert 24. Dezember 2014 bei der Wayback -Maschine
  20. ^ Laurence A. Nafie (2008). "Schwingungskreisendichroismus: Ein neues Werkzeug zur Bestimmung der Struktur und der absoluten Konfiguration von chiralen Naturproduktmolekülen". Natural Product Communications. 3 (3): 451–466.
  21. ^ Jovencio Hilario; David Drapcho; Raul Curbelo; Timothy A. Keiderling (2001). "Polarisationsmodulation Fourier -Transformationsinfrarotspektroskopie mit digitaler Signalverarbeitung: Vergleich der Schwingungskreisendichroismus -Methoden". Angewandte Spektroskopie. 55 (11): 1435–1447. Bibcode:2001APSPE..55.1435H. doi:10.1366/0003702011953810. S2CID 93330435.
  22. ^ Timothy A. Keiderling; Jan Kubelka; Jovencio Hilario (2006). "Schwingungskreisendichroismus von Biopolymeren. Zusammenfassung von Methoden und Anwendungen". In Mark Braiman; Vasilis Gregoriou (Hrsg.). Schwingungsspektroskopie von Polymeren und biologischen Systemen. Boca Raton, FL: CRC Press. S. 253–324. (geschrieben im Jahr 2000, aktualisiert 2003)
  23. ^ T. A. Keiderling (1981). "Beobachtung des magnetischen Schwingungskreisendichroismus". Journal of Chemical Physics. 75 (7): 3639–41. Bibcode:1981Jchph..75.3639k. doi:10.1063/1.442437.
  24. ^ T. R. Devine & T. A. Keiderling (1987). "Schwingungsspektralzuordnung und verbesserte Auflösung unter Verwendung magnetischer Schwingungskreisendichroismus". Spectrochimica Acta. 43a (5): 627–629. Bibcode:1987ACSPA..43..627d. doi:10.1016/0584-8539 (87) 80144-7.
  25. ^ P. V. Croatto; R. K. Yoo; T. A. Keiderling (1989). Cameron, David G (Hrsg.). "Magnetischer Schwingungskreisendichroismus mit einem FTIR". Verfahren von Spie. 7. INTL Conf on Fourier Transform -Spektroskopie. 1145: 152–153. Bibcode:1989spie.1145..152c. doi:10.1117/12.969401. S2CID 95692003.
  26. ^ C. N. Tam & T. A. Keiderling (1995). "Direkte Messung des Rotations-G-Werts im Grundzustand von Acetylen durch magnetische Schwingungskreisendichroismus". Chemische Physikbuchstaben. 243 (1–2): 55–58. Bibcode:1995cpl ... 243 ... 55J. doi:10.1016/0009-2614 (95) 00843-s.
  27. ^ P. Bour; C. N. Tam; T. A. Keiderling (1995). "Ab -Initio -Berechnung des Schwingungs -Magnet -Dipolmoments". Zeitschrift für Physikalische Chemie. 99 (51): 17810–17813. doi:10.1021/j100051a002.
  28. ^ P. Bour; C. N. Tam; B. Wang; T. A. Keiderling (1996). "Rotational aufgelöstes magnetisches Schwingungskreisendichroismus. Experimentelle Spektren und theoretische Simulation für diamagnetische Moleküle". Molekulare Physik. 87 (2): 299–318. Bibcode:1996Molph..87..299b. doi:10.1080/00268979600100201.